21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2481 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2087  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  96.88 
 
 		 577 aa  1117    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.787428 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2481  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 575 aa  1177    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.925318  normal  0.338887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8057  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  55.04 
 
 		 557 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1594  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.81 
 
 		 514 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.867212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1760  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  37.37 
 
 		 553 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.281504  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0412  type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase  37.37 
 
 		 553 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490012  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0848  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  37.37 
 
 		 553 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0542454  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1138  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  37.37 
 
 		 553 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2111  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  37.37 
 
 		 553 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0323  type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase  37.37 
 
 		 553 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1843  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  37.2 
 
 		 553 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169875  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.24 
 
 		 552 aa  276  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.330507 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3303  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.88 
 
 		 555 aa  270  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.195997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1024  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.43 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.414334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.22 
 
 		 558 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4781  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.99 
 
 		 558 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.202057  normal  0.828947 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5490  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.99 
 
 		 558 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0047861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5370  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.99 
 
 		 558 aa  263  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.651157  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5369  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.92 
 
 		 558 aa  259  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0168  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.65 
 
 		 557 aa  259  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.219155  normal  0.140282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2708  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.05 
 
 		 566 aa  250  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>