24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5369 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1843  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  77.84 
 
 		 553 aa  833    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1024  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  74.48 
 
 		 557 aa  803    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.414334 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  71.48 
 
 		 552 aa  784    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.330507 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5369  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 558 aa  1135    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4781  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  90.68 
 
 		 558 aa  1018    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.202057  normal  0.828947 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3303  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  87.28 
 
 		 555 aa  989    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.195997 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2111  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  78.03 
 
 		 553 aa  834    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0323  type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase  78.03 
 
 		 553 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0412  type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase  77.84 
 
 		 553 aa  832    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490012  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1138  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  78.03 
 
 		 553 aa  834    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0848  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  78.03 
 
 		 553 aa  834    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0542454  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5490  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  90.32 
 
 		 558 aa  1005    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0047861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  97.67 
 
 		 558 aa  1080    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5370  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  90.14 
 
 		 558 aa  1004    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.651157  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0168  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  90.84 
 
 		 557 aa  1008    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.219155  normal  0.140282 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1760  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  77.84 
 
 		 553 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.281504  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2708  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.65 
 
 		 566 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1594  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.42 
 
 		 514 aa  323  7e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.867212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8057  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.04 
 
 		 557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2481  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.29 
 
 		 575 aa  264  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.925318  normal  0.338887 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2087  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.12 
 
 		 577 aa  258  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.787428 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1363  sulfatase  25 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0156455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1185  sulfatase  25.64 
 
 		 495 aa  48.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1088  sulfatase  25.64 
 
 		 495 aa  47.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>