21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2087 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2087  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 577 aa  1182    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.787428 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2481  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  97.4 
 
 		 575 aa  1144    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.925318  normal  0.338887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8057  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  54.25 
 
 		 557 aa  534  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1594  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.8 
 
 		 514 aa  344  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.867212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1760  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  37.35 
 
 		 553 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.281504  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0412  type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase  37.35 
 
 		 553 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490012  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0848  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  37.35 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0542454  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1138  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  37.35 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2111  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  37.35 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.84 
 
 		 552 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.330507 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0323  type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase  37.35 
 
 		 553 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1843  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  37.17 
 
 		 553 aa  276  9e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169875  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3303  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.06 
 
 		 555 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.195997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1024  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.19 
 
 		 557 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.414334 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4781  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.59 
 
 		 558 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.202057  normal  0.828947 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5490  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.81 
 
 		 558 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0047861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.22 
 
 		 558 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5370  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.81 
 
 		 558 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.651157  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5369  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.01 
 
 		 558 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0168  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.3 
 
 		 557 aa  257  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.219155  normal  0.140282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2708  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.89 
 
 		 566 aa  243  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>