24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4781 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1843  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  79.65 
 
 
553 aa  840    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1024  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  75 
 
 
557 aa  835    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414334 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  71.84 
 
 
552 aa  799    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.330507 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5369  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  90.68 
 
 
558 aa  1013    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4781  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
558 aa  1134    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.202057  normal  0.828947 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3303  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  90.32 
 
 
555 aa  1017    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.195997 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2111  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  79.84 
 
 
553 aa  842    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0323  type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase  79.84 
 
 
553 aa  841    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0412  type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase  79.65 
 
 
553 aa  840    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490012  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1138  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  79.84 
 
 
553 aa  842    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0848  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  79.84 
 
 
553 aa  842    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0542454  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5490  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  99.1 
 
 
558 aa  1125    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0047861  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  90.14 
 
 
558 aa  1009    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5370  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  98.92 
 
 
558 aa  1123    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.651157  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0168  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  88.69 
 
 
557 aa  994    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.219155  normal  0.140282 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1760  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  79.65 
 
 
553 aa  840    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.281504  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1594  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  42.32 
 
 
514 aa  331  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.867212  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2708  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.28 
 
 
566 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8057  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.16 
 
 
557 aa  297  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2481  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.2 
 
 
575 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.925318  normal  0.338887 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2087  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.59 
 
 
577 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.787428 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1088  sulfatase  25 
 
 
495 aa  44.7  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1363  sulfatase  25.37 
 
 
469 aa  44.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0156455  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1185  sulfatase  25 
 
 
495 aa  45.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>