25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4823 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1843  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  77.89 
 
 		 553 aa  824    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1024  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  74.86 
 
 		 557 aa  810    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.414334 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  71.48 
 
 		 552 aa  778    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.330507 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5369  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  97.67 
 
 		 558 aa  1080    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4781  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  90.14 
 
 		 558 aa  1014    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.202057  normal  0.828947 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3303  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  87.28 
 
 		 555 aa  984    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.195997 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2111  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  78.08 
 
 		 553 aa  826    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.770055  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0323  type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase  78.08 
 
 		 553 aa  825    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0412  type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase  77.89 
 
 		 553 aa  825    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490012  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1138  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  78.08 
 
 		 553 aa  826    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0848  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  78.08 
 
 		 553 aa  826    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0542454  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5490  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  89.78 
 
 		 558 aa  1001    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0047861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 558 aa  1134    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5370  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  89.61 
 
 		 558 aa  999    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.651157  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0168  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  90.48 
 
 		 557 aa  1005    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.219155  normal  0.140282 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1760  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  77.89 
 
 		 553 aa  825    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.281504  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2708  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.79 
 
 		 566 aa  327  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1594  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.99 
 
 		 514 aa  322  8e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.867212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8057  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.61 
 
 		 557 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2481  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.84 
 
 		 575 aa  270  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.925318  normal  0.338887 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2087  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.36 
 
 		 577 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.787428 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1363  sulfatase  24.78 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0156455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1088  sulfatase  24.61 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1185  sulfatase  24.61 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2286  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.79 
 
 		 685 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>