58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1798 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 		 307 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.889521  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3784  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.54 
 
 		 317 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0355  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.39 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3674  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.89 
 
 		 316 aa  146  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5557  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.71 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1821  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.86 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1347  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.74 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0017  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.68 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.629435 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24700  cytochrome c biogenesis protein  32.65 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1522  cytochrome c biogenesis protein  29.78 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00325926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.67 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3167  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.52 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00198959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  28.42 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  28.42 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1241  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.61 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0549817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  29.83 
 
 		 396 aa  59.3  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2163  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.3 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0104507 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2596  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.27 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.08 
 
 		 240 aa  52.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.08 
 
 		 240 aa  52.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3204  autotransporter-associated beta strand repeat protein  26.9 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3443  hypothetical protein  26.9 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0681  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.32 
 
 		 229 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.09 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.44 
 
 		 244 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4203  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.37 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233468 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.15 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.67 
 
 		 244 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.94 
 
 		 445 aa  47  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.32 
 
 		 241 aa  46.6  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.41 
 
 		 218 aa  46.6  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3348  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.41 
 
 		 235 aa  45.8  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000571426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3679  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.41 
 
 		 235 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3727  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.41 
 
 		 235 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3455  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.41 
 
 		 235 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3695  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.41 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1109  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.27 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3367  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  23.41 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260903  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0270  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.44 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.77 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3417  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  23.41 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.297726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1548  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.41 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00245036  hitchhiker  0.0095954 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3703  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.41 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.9 
 
 		 244 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3204  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.42 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3768  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.86 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0366104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2128  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.13 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3738  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.77 
 
 		 246 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0812643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3411  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.94 
 
 		 238 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1617  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.27 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.217228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  26.19 
 
 		 216 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3473  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.32 
 
 		 238 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.320099 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  25.32 
 
 		 230 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1951  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.11 
 
 		 237 aa  43.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0808  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.69 
 
 		 248 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.53 
 
 		 246 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.53 
 
 		 246 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.68 
 
 		 231 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>