50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3784 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3784  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  100 
 
 		 317 aa  622  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0355  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  71.88 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3674  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  69.48 
 
 		 316 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.54 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.889521  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1821  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.39 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5557  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.9 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1347  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.62 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1522  cytochrome c biogenesis protein  31.34 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00325926  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0017  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.38 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.629435 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24700  cytochrome c biogenesis protein  34.3 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3443  hypothetical protein  34.07 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3204  autotransporter-associated beta strand repeat protein  34.07 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3167  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.38 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00198959  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.35 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.35 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.64 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  24.23 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1109  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.91 
 
 		 237 aa  57  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.66 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1951  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.5 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2128  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.38 
 
 		 235 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0681  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.14 
 
 		 229 aa  53.1  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  26.61 
 
 		 735 aa  51.6  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1241  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.16 
 
 		 227 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0549817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5009  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.52 
 
 		 268 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.082972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.49 
 
 		 235 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.965188  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2146  cytochrome c biogenesis protein  30.49 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0617125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4430  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.05 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3455  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.58 
 
 		 235 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3679  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.58 
 
 		 235 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3727  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.58 
 
 		 235 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3348  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.58 
 
 		 235 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000571426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3367  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  23.58 
 
 		 235 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260903  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3703  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.17 
 
 		 235 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3695  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.17 
 
 		 235 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3417  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  23.17 
 
 		 235 aa  46.2  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.297726  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1811  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.67 
 
 		 398 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000275773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4203  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.32 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233468 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  22.89 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3738  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25 
 
 		 246 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0812643  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0270  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.36 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  29.24 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3411  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.12 
 
 		 238 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1735  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.22 
 
 		 401 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6714  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.78 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.05 
 
 		 259 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0706  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.05 
 
 		 259 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.10539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.05 
 
 		 259 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482299  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24340  cytochrome c biogenesis protein  29.61 
 
 		 271 aa  42.7  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.42 
 
 		 227 aa  42.7  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>