46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3674 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3674  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 		 316 aa  617  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0355  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  77.54 
 
 		 327 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3784  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  69.48 
 
 		 317 aa  394  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.89 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.889521  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5557  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.98 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1821  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.53 
 
 		 303 aa  96.7  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1347  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.59 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1522  cytochrome c biogenesis protein  32.84 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00325926  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24700  cytochrome c biogenesis protein  34.22 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0017  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.79 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.629435 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.54 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.54 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3167  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.57 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00198959  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0270  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.49 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.88 
 
 		 242 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1109  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.08 
 
 		 237 aa  52.8  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3443  hypothetical protein  31.72 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.11 
 
 		 266 aa  52.8  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3204  autotransporter-associated beta strand repeat protein  31.72 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5009  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.56 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.082972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.79 
 
 		 235 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.965188  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.8 
 
 		 253 aa  49.7  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2128  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.05 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1951  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.94 
 
 		 237 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4430  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.18 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4485  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.44 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0690  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.9 
 
 		 261 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3455  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.36 
 
 		 235 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3679  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.36 
 
 		 235 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3727  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.36 
 
 		 235 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3348  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.36 
 
 		 235 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000571426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3367  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  23.93 
 
 		 235 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3695  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.93 
 
 		 235 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3417  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  23.93 
 
 		 235 aa  46.2  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.297726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3703  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.93 
 
 		 235 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3768  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  24.41 
 
 		 235 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0366104  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0681  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.43 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1548  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  23.94 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00245036  hitchhiker  0.0095954 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  26.44 
 
 		 396 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.58 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  30.98 
 
 		 603 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1241  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.34 
 
 		 227 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0549817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  28.29 
 
 		 735 aa  44.3  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4519  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.76 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0363531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0573  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.14 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3428  cytochrome c-type biogenesis protein ccdA  31.28 
 
 		 222 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0739386  normal  0.0766183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>