36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0355 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0355  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 
327 aa  634    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3674  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  78.7 
 
 
316 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3784  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  68.47 
 
 
317 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.67 
 
 
307 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.889521  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1821  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35 
 
 
303 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5557  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.91 
 
 
286 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354841  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1347  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.14 
 
 
301 aa  96.3  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1522  cytochrome c biogenesis protein  32.83 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00325926  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0017  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.72 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.629435 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24700  cytochrome c biogenesis protein  34.47 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3167  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.34 
 
 
306 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00198959  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.03 
 
 
240 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.03 
 
 
240 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.51 
 
 
305 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3443  hypothetical protein  31.55 
 
 
222 aa  49.3  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11211  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3204  autotransporter-associated beta strand repeat protein  31.55 
 
 
222 aa  49.3  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.67 
 
 
242 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1109  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.41 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1951  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.56 
 
 
237 aa  46.2  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3695  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.55 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3455  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.55 
 
 
235 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3417  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  27.55 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.297726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3367  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  27.55 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260903  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3727  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.55 
 
 
235 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  27.95 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.04 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.965188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3679  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.55 
 
 
235 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3703  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.55 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3348  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.55 
 
 
235 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000571426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1548  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.55 
 
 
235 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00245036  hitchhiker  0.0095954 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3768  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.55 
 
 
235 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0366104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2596  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.79 
 
 
236 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4210  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.58 
 
 
245 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2128  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.62 
 
 
235 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5009  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.57 
 
 
268 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.082972  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4125  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 
399 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0162627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>