14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5147 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5147    100 
 
 		 507 bp  1005    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1507  D-fructose 1,6-bisphosphatase  100 
 
 		 840 bp  65.9  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000436712  hitchhiker  0.00358569 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6490  ABC transporter related  100 
 
 		 735 bp  61.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6492  EAL  100 
 
 		 456 bp  61.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  100 
 
 		 672 bp  61.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1492  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 861 bp  61.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00472623  normal  0.0479815 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2154  hypothetical protein  100 
 
 		 495 bp  61.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0190416 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3043  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 1227 bp  61.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1201    100 
 
 		 207 bp  54  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3008  putative transposase  100 
 
 		 360 bp  54  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5145  transposase Tn3  100 
 
 		 1008 bp  54  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0512  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 		 528 bp  50.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  90 
 
 		 1596 bp  48.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.290961  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4041  hypothetical protein  96.3 
 
 		 714 bp  46.1  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.485745  normal  0.10091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>