11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3925 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3925  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  304  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.121433 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3816  Fimbrial protein  52.45 
 
 		 222 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351886 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3929  Fimbrial protein  52.45 
 
 		 222 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0765  Fimbrial protein  50.82 
 
 		 209 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.146412  normal  0.0127423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0836  Fimbrial protein  43.54 
 
 		 298 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.252785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  35.71 
 
 		 336 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1678  fimbrial family protein  34.72 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1789  fimbrial protein  34.72 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00112621  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3037  fimbrial protein  30.84 
 
 		 351 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130146  normal  0.538691 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0010  Fimbrial protein  31.25 
 
 		 319 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0010  Fimbrial protein  29.46 
 
 		 319 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>