More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1306 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1306  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 		 246 aa  483  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0447372  normal  0.269549 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1240  peptidase M22 glycoprotease  93.5 
 
 		 246 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1367  putative transmembrane protein  89.18 
 
 		 243 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.742517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1939  peptidase M22, glycoprotease  61.67 
 
 		 282 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1395  peptidase M22, glycoprotease  63.98 
 
 		 281 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.834993 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1582  glycoprotease family protein  56.33 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2610  glycoprotease family protein  56.33 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2465  glycoprotease family protein  56.33 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2521  glycoprotease family protein  56.33 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3228  glycoprotease family protein  56.33 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1357  glycoprotease family protein  56.33 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0779357  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2084  glycoprotease family protein  56.33 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1365  peptidase M22 glycoprotease  51.02 
 
 		 279 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2001  glycoprotease family protein  53.94 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274689  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1654  peptidase M22, glycoprotease  51.76 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786528  decreased coverage  0.00849888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1946  peptidase M22 glycoprotease  54.44 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6032  peptidase M22, glycoprotease  54.44 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.827723  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2045  peptidase M22, glycoprotease  54.44 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1232  peptidase M22 glycoprotease  54.94 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  0.181812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2483  peptidase M22 glycoprotease  53.91 
 
 		 276 aa  191  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.318654  hitchhiker  0.00075041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2064  peptidase M22 glycoprotease  54.03 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5354  peptidase M22, glycoprotease  53.23 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2077  peptidase M22, glycoprotease  54.29 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5085  peptidase M22 glycoprotease  50.43 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  43.72 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  45.15 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  40.89 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3846  peptidase M22, glycoprotease  41.94 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2257  peptidase M22 glycoprotease  44.83 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0733925  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4459  peptidase M22, glycoprotease  43.03 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293855  normal  0.853274 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  39.92 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3940  peptidase M22, glycoprotease  43.86 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  42.06 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  39.13 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0189  peptidase M22, glycoprotease  40.89 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  40.43 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  38.6 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  38.67 
 
 		 233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  37.07 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  40 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  40.87 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3289  peptidase M22 glycoprotease  45.2 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  38.53 
 
 		 233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  39.65 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  40.43 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4621  peptidase M22, glycoprotease  43.48 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  40.53 
 
 		 224 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  38.53 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  40.79 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0976  peptidase M22 glycoprotease  40.35 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  37.77 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  38.02 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  39.83 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0915  peptidase M22, glycoprotease  36.28 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  39.83 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  39.83 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  41.05 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  38.63 
 
 		 233 aa  122  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  41.05 
 
 		 226 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  38.52 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  39.83 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  39.83 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  38.08 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  36.32 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  38.6 
 
 		 223 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4569  peptidase M22, glycoprotease  44.87 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  36.48 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  36.48 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  36.48 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  37.34 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  36.48 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  36.48 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  36.48 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  38.03 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  36.48 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  36.64 
 
 		 233 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2231  peptidase M22, glycoprotease  39.32 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  36.05 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1981  peptidase M22, glycoprotease  41.45 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.637689 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  36.36 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  36.36 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  36.09 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1410  peptidase M22 glycoprotease  45 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  36.36 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  36.36 
 
 		 237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  36 
 
 		 236 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1458  non-proteolytic protein, peptidase family M22  34.38 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  37.72 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  35.8 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  35.8 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  35.8 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0784  peptidase M22 glycoprotease  36.51 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318216  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  35.93 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39270  Peptidase M22, glycoprotease  38.82 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1527  M22 peptidase homolog yeaZ  33.93 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  38.2 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1193  peptidase M22, glycoprotease  38.67 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  33.78 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  33.78 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0872  hypothetical protein  36.6 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000381298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>