More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3846 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3846  peptidase M22, glycoprotease  100 
 
 
259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4621  peptidase M22, glycoprotease  72.98 
 
 
260 aa  305  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0189  peptidase M22, glycoprotease  61.04 
 
 
239 aa  235  6e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5085  peptidase M22 glycoprotease  58.65 
 
 
239 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3940  peptidase M22, glycoprotease  56.6 
 
 
236 aa  218  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4459  peptidase M22, glycoprotease  53.66 
 
 
236 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293855  normal  0.853274 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3289  peptidase M22 glycoprotease  56.84 
 
 
236 aa  199  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0976  peptidase M22 glycoprotease  48.16 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4569  peptidase M22, glycoprotease  53.75 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1367  putative transmembrane protein  44.73 
 
 
243 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.742517  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1240  peptidase M22 glycoprotease  41.53 
 
 
246 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1939  peptidase M22, glycoprotease  44.44 
 
 
282 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1365  peptidase M22 glycoprotease  41.9 
 
 
279 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1306  peptidase M22 glycoprotease  42.62 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0447372  normal  0.269549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1654  peptidase M22, glycoprotease  41.31 
 
 
267 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786528  decreased coverage  0.00849888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1395  peptidase M22, glycoprotease  43.1 
 
 
281 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.834993 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6032  peptidase M22, glycoprotease  44.09 
 
 
255 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.827723  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2045  peptidase M22, glycoprotease  44.09 
 
 
255 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0370  peptidase M22 glycoprotease  40.46 
 
 
248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347647 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2064  peptidase M22 glycoprotease  41.8 
 
 
255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2483  peptidase M22 glycoprotease  41.43 
 
 
276 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.318654  hitchhiker  0.00075041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2001  glycoprotease family protein  41.27 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2465  glycoprotease family protein  40.64 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2521  glycoprotease family protein  40.64 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1582  glycoprotease family protein  40.64 
 
 
256 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2610  glycoprotease family protein  40.64 
 
 
256 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2084  glycoprotease family protein  40.64 
 
 
249 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3228  glycoprotease family protein  40.64 
 
 
249 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1357  glycoprotease family protein  40.64 
 
 
249 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0779357  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0301  putative transmembrane protein  41.8 
 
 
243 aa  131  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.903385  normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5354  peptidase M22, glycoprotease  42.91 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1946  peptidase M22 glycoprotease  41.2 
 
 
255 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2077  peptidase M22, glycoprotease  41.2 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1232  peptidase M22 glycoprotease  41.53 
 
 
255 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  0.181812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1981  peptidase M22, glycoprotease  41.6 
 
 
229 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.637689 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  40 
 
 
231 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  36.89 
 
 
223 aa  122  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  32.2 
 
 
223 aa  116  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  32.63 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  39.06 
 
 
224 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  38.53 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  38.63 
 
 
224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  41.13 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  34.75 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  38.2 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  37.39 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  38.2 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  35.81 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  35.78 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  37.83 
 
 
224 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0927  peptidase M22 glycoprotease  36.1 
 
 
238 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  32.91 
 
 
231 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  32.91 
 
 
231 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  32.91 
 
 
231 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  32.91 
 
 
231 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  32.91 
 
 
231 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  34.3 
 
 
237 aa  105  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  33.19 
 
 
233 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  32.91 
 
 
231 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  36.97 
 
 
228 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  33.61 
 
 
247 aa  102  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  35.74 
 
 
224 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  31.76 
 
 
233 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  31.56 
 
 
239 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  34.44 
 
 
228 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  32.91 
 
 
238 aa  99  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2257  peptidase M22 glycoprotease  34.84 
 
 
230 aa  98.6  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0733925  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  32.77 
 
 
235 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  35.15 
 
 
236 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  31.67 
 
 
237 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39270  Peptidase M22, glycoprotease  33.91 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  32.05 
 
 
236 aa  97.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0915  peptidase M22, glycoprotease  38.1 
 
 
225 aa  96.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  31.09 
 
 
238 aa  96.3  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  34.4 
 
 
237 aa  95.9  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1410  peptidase M22 glycoprotease  36.24 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  32.48 
 
 
233 aa  94.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  32.35 
 
 
233 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  31.78 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1527  M22 peptidase homolog yeaZ  32.99 
 
 
226 aa  94  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306852  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  31.78 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  30.51 
 
 
231 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  31.78 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  30.17 
 
 
231 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  30.17 
 
 
231 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  30.17 
 
 
231 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1458  non-proteolytic protein, peptidase family M22  32.99 
 
 
226 aa  93.6  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  32.2 
 
 
233 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2231  peptidase M22, glycoprotease  35.15 
 
 
233 aa  93.2  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391268  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  30.29 
 
 
231 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  30.29 
 
 
231 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  30.29 
 
 
231 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  30.29 
 
 
231 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  34.3 
 
 
237 aa  92.4  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  29.79 
 
 
239 aa  92  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  31.9 
 
 
234 aa  92  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  29.88 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  33.9 
 
 
233 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  32.48 
 
 
233 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  32.47 
 
 
236 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>