204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4221 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4221  Siderophore-interacting protein  100 
 
 
242 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186692  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  40.74 
 
 
247 aa  142  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.57 
 
 
271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  33.2 
 
 
275 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  33.2 
 
 
275 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  33.2 
 
 
275 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  33.2 
 
 
275 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  33.2 
 
 
275 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  33.2 
 
 
275 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  33.2 
 
 
275 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.97 
 
 
281 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  34.25 
 
 
297 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  36.73 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  34.66 
 
 
348 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  34.66 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  34.13 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  34.47 
 
 
289 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  32.42 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2173  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.44 
 
 
256 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0791652  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  33.59 
 
 
284 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  32.7 
 
 
617 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  33.47 
 
 
288 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2448  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.35 
 
 
256 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  35.47 
 
 
304 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  33.61 
 
 
272 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  31.3 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  33.07 
 
 
281 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  30.95 
 
 
290 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2762  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.87 
 
 
299 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1452  Siderophore-interacting protein  35.46 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.100932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  33.2 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0911  siderophore-interacting protein  37 
 
 
234 aa  116  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0168967  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  33.48 
 
 
247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  30.59 
 
 
255 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  35.11 
 
 
340 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  31.89 
 
 
270 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  31.28 
 
 
274 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  32.03 
 
 
267 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  32.55 
 
 
623 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  32.67 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3561  Siderophore-interacting protein  34.59 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  30.59 
 
 
255 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  30.2 
 
 
273 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.16 
 
 
273 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  33.33 
 
 
250 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  30.98 
 
 
273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32.44 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.62 
 
 
283 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  33.78 
 
 
252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  31.44 
 
 
248 aa  112  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  33.2 
 
 
366 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  30.98 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  30.98 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  33.88 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  31.76 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  36.81 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.89 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0091  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  31.44 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4066  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.75 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515055 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  33.2 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  32.31 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3953  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.75 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.568339  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.55 
 
 
289 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  29.02 
 
 
312 aa  109  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.85 
 
 
283 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2392  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  28.94 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.64 
 
 
270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32.81 
 
 
253 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  31.62 
 
 
250 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  38.07 
 
 
267 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  31.78 
 
 
251 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  30.98 
 
 
274 aa  108  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  34.5 
 
 
276 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03709  hypothetical protein  31.43 
 
 
277 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3473  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.64 
 
 
305 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100108  hitchhiker  0.00465132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  32.81 
 
 
253 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.89 
 
 
252 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  30.43 
 
 
275 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3532  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.02 
 
 
257 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30 
 
 
274 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.03 
 
 
253 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1437  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.29 
 
 
315 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458748  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  30.84 
 
 
246 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  32.94 
 
 
361 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03816  putative siderophore utilization protein  29.51 
 
 
257 aa  102  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  29.83 
 
 
277 aa  101  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3213  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.67 
 
 
325 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000110595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.66 
 
 
281 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2591  Siderophore-interacting protein  29.69 
 
 
304 aa  99.4  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000968447  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5386  Siderophore-interacting protein  32.48 
 
 
251 aa  99  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0562315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5549  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.03 
 
 
308 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438451  normal  0.147517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  28.05 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  35.87 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.29 
 
 
279 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0811  FAD-binding 9, siderophore-interacting  33.04 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.330061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3252  hypothetical protein  33.88 
 
 
302 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  34.03 
 
 
281 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  28.46 
 
 
278 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0424  Siderophore-interacting protein  28.81 
 
 
321 aa  96.3  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.625757 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0833  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.17 
 
 
267 aa  95.5  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>