42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4424 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4424  methyltransferase type 11  100 
 
 		 239 aa  490  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.203515  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1513  hypothetical protein  29.41 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  0.422698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.39 
 
 		 236 aa  49.7  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  31.46 
 
 		 198 aa  49.3  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0535  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.92 
 
 		 241 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.77555  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2762  methyltransferase  24.37 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2769  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479645  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.63 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  34.78 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  30.25 
 
 		 233 aa  45.8  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.07 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.93 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.29 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5285  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  29.27 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1044  Methyltransferase type 11  21.1 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  36.76 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  21.43 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.52 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 274 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.81 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.43 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  35.24 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  24.82 
 
 		 581 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  29.7 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  29.7 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 254 aa  42.4  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  24.35 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 201 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 286 aa  42  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  26.4 
 
 		 575 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 254 aa  42  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  24.35 
 
 		 248 aa  42  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 269 aa  42  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>