More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1592 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1592  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
276 aa  540  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.36 
 
 
276 aa  412  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0227  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.92 
 
 
327 aa  206  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.112793  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0926  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  39.31 
 
 
271 aa  170  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000301114  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0376  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.84 
 
 
363 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.640988  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0873  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  32.26 
 
 
265 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122179 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0131  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component  34.13 
 
 
289 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0113761  hitchhiker  0.00000772966 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1451  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.28 
 
 
269 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349089  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl571  phosphonate ABC transporter permease component  26.02 
 
 
871 aa  102  5e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.720919  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.67 
 
 
277 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.67 
 
 
277 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.68 
 
 
511 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.82 
 
 
266 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3472  phosphonate ABC transporter permease  38.79 
 
 
267 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3438  phosphonate ABC transporter, permease  38.79 
 
 
267 aa  99.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.573649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3389  phosphonate ABC transporter, permease  38.79 
 
 
267 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00227176  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3747  phosphonate ABC transporter permease  38.79 
 
 
267 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.375049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3701  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
267 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3370  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.79 
 
 
267 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3720  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
267 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0181873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3743  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
267 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000033324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1523  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137606  normal  0.0137345 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3792  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
267 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.23 
 
 
294 aa  99.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0337  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component  35.45 
 
 
269 aa  99  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.65 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.78 
 
 
533 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3263  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.21 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.857467  normal  0.639309 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2337  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.18 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000326587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.12 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 
259 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  30.46 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  29.12 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 
259 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  29.12 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0827  alkylphosphonate ABC transporter, permease protein  27.18 
 
 
911 aa  94  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0384777  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 
259 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  36.26 
 
 
294 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  29.12 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.46 
 
 
259 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  29.12 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  29.12 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.18 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4785  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.11 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161487  normal  0.0587654 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4151  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.1 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  28.89 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2297  ABC phosphonate permease  38.41 
 
 
268 aa  92.8  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2287  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.1 
 
 
274 aa  92.8  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 
264 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0436  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.98 
 
 
322 aa  92.4  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4203  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.57 
 
 
294 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.852389  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0182  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.59 
 
 
542 aa  92  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  37.42 
 
 
293 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  35.67 
 
 
293 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  28.77 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.14 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.5 
 
 
341 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.5 
 
 
341 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.96 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.15 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.26 
 
 
272 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.35 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.79 
 
 
276 aa  89.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20330  phosphonate ABC tranporter permease protein  35.76 
 
 
264 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293398  normal  0.582568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1747  phosphonate ABC transporter permease PhnE  35.76 
 
 
264 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3259  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.51 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966074  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  31.15 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2011  putative ABC transporter inner membrane component  34.62 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.050434  normal  0.0106691 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  30.37 
 
 
275 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.79 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.79 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.16 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2675  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.7 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0563966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4959  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  30.5 
 
 
588 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4666  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
320 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00096025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17510  Phosphonate transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
269 aa  86.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3864  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  35.21 
 
 
280 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2249  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.05 
 
 
262 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.859646  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3236  phosphonate ABC transporter permease  31.02 
 
 
276 aa  86.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4429  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.51 
 
 
319 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.21 
 
 
266 aa  85.9  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3860  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.88 
 
 
293 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2557  phosphonates ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 
262 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0896  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.89 
 
 
295 aa  85.9  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0131  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.11 
 
 
271 aa  85.5  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0126  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.11 
 
 
271 aa  85.5  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4115  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.21 
 
 
319 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2202  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  32.8 
 
 
542 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2283  phosphonate ABC transporter, permease protein  32.64 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0849085  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.12 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2876  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.38 
 
 
286 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0183  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  32.08 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685184  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2918  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.52 
 
 
294 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0177  phosphonate ABC transporter permease  32.69 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000132377  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.96 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>