More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0926 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0926  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
271 aa  537  9.999999999999999e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000301114  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0227  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.47 
 
 
327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.112793  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1592  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.46 
 
 
276 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
276 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  33.97 
 
 
259 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
272 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  33.49 
 
 
272 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  33.49 
 
 
259 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.49 
 
 
259 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 
271 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 
271 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  33.49 
 
 
259 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 
271 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  33.49 
 
 
259 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  33.49 
 
 
259 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  36.32 
 
 
294 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4203  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.22 
 
 
294 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.852389  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.54 
 
 
259 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  30.09 
 
 
280 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  30.62 
 
 
271 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  30.62 
 
 
271 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2918  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.64 
 
 
294 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  30.62 
 
 
271 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  30.62 
 
 
271 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.77 
 
 
290 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.17 
 
 
294 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.63 
 
 
280 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  27.19 
 
 
271 aa  99.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  35.16 
 
 
293 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0376  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.44 
 
 
363 aa  99.4  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.640988  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.17 
 
 
280 aa  99  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.3 
 
 
277 aa  99  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.11 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  32.12 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3860  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.52 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2876  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.63 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.73 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.97 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4151  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.14 
 
 
274 aa  96.3  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0183  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  35.26 
 
 
267 aa  95.9  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685184  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0131  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component  34 
 
 
289 aa  95.9  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0113761  hitchhiker  0.00000772966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2287  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.14 
 
 
274 aa  95.9  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1343  phosphonate ABC transporter permease  31.63 
 
 
286 aa  95.5  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0495626 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2797  phosphonate ABC transporter, permease protein  31.63 
 
 
286 aa  95.5  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  35.8 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0337  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component  31.51 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.29 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0896  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.05 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.49 
 
 
269 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1747  phosphonate ABC transporter permease PhnE  34.86 
 
 
264 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.63 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20330  phosphonate ABC tranporter permease protein  34.86 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293398  normal  0.582568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.81 
 
 
266 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4995  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.71 
 
 
245 aa  92.4  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250762  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3792  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.23 
 
 
267 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.63 
 
 
276 aa  92  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.63 
 
 
276 aa  92  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.52 
 
 
277 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.52 
 
 
277 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0827  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152622  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1451  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.02 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2249  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.37 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.859646  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3236  phosphonate ABC transporter permease  30.37 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2557  phosphonates ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  30.61 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2202  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  29.35 
 
 
542 aa  90.5  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4959  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  27.4 
 
 
588 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3370  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.21 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1523  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.21 
 
 
267 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137606  normal  0.0137345 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2993  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  32.46 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2674  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.46 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3720  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.21 
 
 
267 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0181873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3472  phosphonate ABC transporter permease  35.23 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3701  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.23 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177586 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3743  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.23 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000033324  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3747  phosphonate ABC transporter permease  35.23 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.375049  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3438  phosphonate ABC transporter, permease  35.23 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.573649  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl571  phosphonate ABC transporter permease component  31.12 
 
 
871 aa  89.4  6e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.720919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3389  phosphonate ABC transporter, permease  35.23 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00227176  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.47 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.65 
 
 
511 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0182  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.47 
 
 
542 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1450  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.33 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.126194  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4785  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.47 
 
 
280 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161487  normal  0.0587654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17510  Phosphonate transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
269 aa  86.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2675  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.43 
 
 
297 aa  86.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0563966 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12521  hypothetical protein  30.14 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.285208  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32 
 
 
341 aa  85.9  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32 
 
 
341 aa  85.9  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0773  phosphonate ABC transporter permease  30.25 
 
 
292 aa  85.5  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741951  normal  0.989098 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1321  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.53 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0827  alkylphosphonate ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 
911 aa  85.1  0.000000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0384777  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  31.28 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0873  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  24.74 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122179 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  31.28 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0998  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.97 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2337  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.13 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000326587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0177  phosphonate ABC transporter permease  28.39 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000132377  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3707  phosphonate ABC transporter permease  28.64 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.324444 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0859  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.94 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0148333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>