14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1498 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1498  cytochrome c, class I  100 
 
 		 146 aa  300  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2631  cytochrome c class I  89.12 
 
 		 147 aa  252  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2655  cytochrome c class I  48.32 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2484  cytochrome c, class I  53.66 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.789721  normal  0.114266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2363  cytochrome c class I  56.44 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.217557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4251  cytochrome c class I  31.31 
 
 		 286 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0839506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 348 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5275  cytochrome c-related protein  29.06 
 
 		 320 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0648  cytochrome c family protein  25.62 
 
 		 332 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1020  cytochrome c, class I  32 
 
 		 135 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  29.8 
 
 		 690 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1397  cytochrome c family protein, putative  40 
 
 		 567 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  29.63 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  27.03 
 
 		 87 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>