17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2484 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2484  cytochrome c, class I  100 
 
 		 138 aa  274  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.789721  normal  0.114266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2363  cytochrome c class I  84.78 
 
 		 138 aa  207  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.217557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1498  cytochrome c, class I  52.59 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2631  cytochrome c class I  52.03 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2655  cytochrome c class I  46.48 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  38.83 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4251  cytochrome c class I  28.93 
 
 		 286 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0839506  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5275  cytochrome c-related protein  28.76 
 
 		 320 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0414  cytochrome c class I  33.04 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.299698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  28.89 
 
 		 367 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0039  cytochrome c, membrane-bound  32.14 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0039  cytochrome c, membrane-bound  32.14 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  33.64 
 
 		 322 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  27 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2070  cytochrome c2  31.19 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  29.17 
 
 		 346 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1880  cytochrome c, class I  31.19 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>