20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2363 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2363  cytochrome c class I  100 
 
 		 138 aa  273  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.217557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2484  cytochrome c, class I  84.78 
 
 		 138 aa  208  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.789721  normal  0.114266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2631  cytochrome c class I  59.41 
 
 		 147 aa  123  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1498  cytochrome c, class I  48.94 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2655  cytochrome c class I  51.82 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4251  cytochrome c class I  32.03 
 
 		 286 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0839506  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  36.89 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  34.4 
 
 		 367 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  32.8 
 
 		 370 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  31.36 
 
 		 293 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0039  cytochrome c, membrane-bound  31.06 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1172  cytochrome c class I  36.27 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0039  cytochrome c, membrane-bound  31.06 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  32.43 
 
 		 371 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  46.15 
 
 		 1577 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3439  cytochrome c2  29.23 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  30.95 
 
 		 384 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  25 
 
 		 87 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2595  cytochrome c class I  25.86 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0211957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  26.36 
 
 		 278 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>