34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1928 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1928  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  460  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6341  hypothetical protein  87.56 
 
 		 225 aa  410  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0499  hypothetical protein  64.57 
 
 		 225 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0512  hypothetical protein  64.13 
 
 		 225 aa  297  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.448223  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0924  hypothetical protein  52.38 
 
 		 251 aa  232  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.275448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3035  hypothetical protein  54.46 
 
 		 229 aa  224  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.225434  normal  0.011073 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6313  hypothetical protein  50.23 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384362  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3812  hypothetical protein  52.78 
 
 		 233 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.626141  hitchhiker  0.0015412 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3579  hypothetical protein  51.08 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4173  hypothetical protein  52.36 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4695  hypothetical protein  52.83 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.915611 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4788  hypothetical protein  51.08 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5495  hypothetical protein  51.08 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543454  normal  0.390544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0510  hypothetical protein  51.83 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2408  hypothetical protein  52.61 
 
 		 229 aa  218  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3819  hypothetical protein  51.18 
 
 		 229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4661  hypothetical protein  50.71 
 
 		 246 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.560246  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3702  hypothetical protein  50.71 
 
 		 246 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.750738  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5039  hypothetical protein  49.05 
 
 		 226 aa  204  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1882  hypothetical protein  50.48 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1689  hypothetical protein  48.6 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0041  putative alcohol dehydrogenase class III  48.82 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5346  hypothetical protein  48.1 
 
 		 226 aa  198  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1445  hypothetical protein  43.44 
 
 		 225 aa  197  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3585  hypothetical protein  50 
 
 		 228 aa  197  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1981  hypothetical protein  49.52 
 
 		 228 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.269571  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3905  hypothetical protein  42.67 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3449  hypothetical protein  41.71 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139158  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3156  hypothetical protein  41.04 
 
 		 217 aa  149  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4368  hypothetical protein  36.49 
 
 		 225 aa  138  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4209  hypothetical protein  35.84 
 
 		 246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.630826  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3539  hypothetical protein  33.48 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3239  hypothetical protein  32.14 
 
 		 228 aa  118  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0072  hypothetical protein  22.09 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>