34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6341 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6341  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  461  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1928  hypothetical protein  87.56 
 
 
225 aa  410  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0499  hypothetical protein  62.33 
 
 
225 aa  287  7e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0512  hypothetical protein  61.88 
 
 
225 aa  285  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.448223  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0924  hypothetical protein  51.08 
 
 
251 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.275448  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2408  hypothetical protein  50.88 
 
 
229 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6313  hypothetical protein  49.77 
 
 
232 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384362  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4695  hypothetical protein  50.94 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.915611 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4173  hypothetical protein  50.47 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0510  hypothetical protein  49.76 
 
 
230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4788  hypothetical protein  49.78 
 
 
233 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5495  hypothetical protein  49.78 
 
 
233 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543454  normal  0.390544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3579  hypothetical protein  49.78 
 
 
233 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3035  hypothetical protein  52.11 
 
 
229 aa  211  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.225434  normal  0.011073 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3819  hypothetical protein  49.56 
 
 
229 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717629  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3702  hypothetical protein  49.56 
 
 
246 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.750738  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4661  hypothetical protein  49.56 
 
 
246 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.560246  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3812  hypothetical protein  50.94 
 
 
233 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.626141  hitchhiker  0.0015412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5039  hypothetical protein  47.77 
 
 
226 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1445  hypothetical protein  43.95 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218218  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1882  hypothetical protein  47.75 
 
 
228 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5346  hypothetical protein  47.62 
 
 
226 aa  193  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0041  putative alcohol dehydrogenase class III  46.85 
 
 
228 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1689  hypothetical protein  46.26 
 
 
228 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3585  hypothetical protein  47.62 
 
 
228 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1981  hypothetical protein  47.62 
 
 
228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.269571  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3905  hypothetical protein  43.61 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561069  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3449  hypothetical protein  43.13 
 
 
230 aa  174  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139158  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3156  hypothetical protein  43.28 
 
 
217 aa  151  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4368  hypothetical protein  37.38 
 
 
225 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4209  hypothetical protein  35.4 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.630826  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3539  hypothetical protein  32.29 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3239  hypothetical protein  30.8 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0072  hypothetical protein  22.35 
 
 
202 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>