34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4209 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4209  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  476  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.630826  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3539  hypothetical protein  67.98 
 
 
228 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3239  hypothetical protein  66.67 
 
 
228 aa  299  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0924  hypothetical protein  42.66 
 
 
251 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.275448  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3035  hypothetical protein  41.98 
 
 
229 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.225434  normal  0.011073 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5495  hypothetical protein  42.13 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543454  normal  0.390544 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4788  hypothetical protein  42.13 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3579  hypothetical protein  42.13 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3812  hypothetical protein  39.91 
 
 
233 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.626141  hitchhiker  0.0015412 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4173  hypothetical protein  40.37 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4695  hypothetical protein  39.91 
 
 
233 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.915611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1928  hypothetical protein  35.84 
 
 
225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2408  hypothetical protein  37.79 
 
 
229 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3819  hypothetical protein  38.25 
 
 
229 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717629  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4661  hypothetical protein  38.25 
 
 
246 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.560246  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3702  hypothetical protein  38.25 
 
 
246 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.750738  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6341  hypothetical protein  35.4 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0041  putative alcohol dehydrogenase class III  37.12 
 
 
228 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6313  hypothetical protein  39.07 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4368  hypothetical protein  39.17 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5039  hypothetical protein  42.16 
 
 
226 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1445  hypothetical protein  32 
 
 
225 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218218  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3905  hypothetical protein  35.86 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561069  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3449  hypothetical protein  36.96 
 
 
230 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139158  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3156  hypothetical protein  42.22 
 
 
217 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5346  hypothetical protein  40.38 
 
 
226 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0512  hypothetical protein  34.91 
 
 
225 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.448223  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0510  hypothetical protein  36.02 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0499  hypothetical protein  34.91 
 
 
225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1882  hypothetical protein  33.82 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1689  hypothetical protein  33.17 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1981  hypothetical protein  35.29 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.269571  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3585  hypothetical protein  32.38 
 
 
228 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0072  hypothetical protein  24.88 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>