34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5346 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5346  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  447  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5039  hypothetical protein  83.63 
 
 		 226 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6313  hypothetical protein  54.21 
 
 		 232 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384362  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0041  putative alcohol dehydrogenase class III  54.71 
 
 		 228 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3819  hypothetical protein  54.19 
 
 		 229 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3702  hypothetical protein  54.19 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.750738  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4661  hypothetical protein  54.19 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.560246  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2408  hypothetical protein  53.51 
 
 		 229 aa  234  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1981  hypothetical protein  54.46 
 
 		 228 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.269571  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3585  hypothetical protein  52.68 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1882  hypothetical protein  51.34 
 
 		 228 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0510  hypothetical protein  53.77 
 
 		 230 aa  225  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1445  hypothetical protein  52.43 
 
 		 225 aa  218  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1689  hypothetical protein  53.69 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3905  hypothetical protein  51.63 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3035  hypothetical protein  50 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.225434  normal  0.011073 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3449  hypothetical protein  47.47 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139158  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1928  hypothetical protein  48.1 
 
 		 225 aa  198  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3156  hypothetical protein  51.89 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6341  hypothetical protein  47.62 
 
 		 225 aa  193  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4173  hypothetical protein  49.76 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0512  hypothetical protein  46.67 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.448223  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4788  hypothetical protein  49.76 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5495  hypothetical protein  49.76 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543454  normal  0.390544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3579  hypothetical protein  49.76 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0499  hypothetical protein  46.67 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0924  hypothetical protein  48.33 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.275448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3812  hypothetical protein  48.8 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.626141  hitchhiker  0.0015412 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4695  hypothetical protein  45.65 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.915611 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4368  hypothetical protein  41.78 
 
 		 225 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4209  hypothetical protein  40.38 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.630826  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3539  hypothetical protein  36 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3239  hypothetical protein  35.29 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0072  hypothetical protein  30.77 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>