34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4173 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4173  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4695  hypothetical protein  95.28 
 
 		 233 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.915611 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0924  hypothetical protein  89.27 
 
 		 251 aa  423  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.275448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5495  hypothetical protein  86.27 
 
 		 233 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543454  normal  0.390544 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4788  hypothetical protein  86.27 
 
 		 233 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3579  hypothetical protein  86.27 
 
 		 233 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3812  hypothetical protein  85.41 
 
 		 233 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.626141  hitchhiker  0.0015412 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3035  hypothetical protein  56.22 
 
 		 229 aa  257  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.225434  normal  0.011073 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1928  hypothetical protein  52.36 
 
 		 225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0499  hypothetical protein  48.05 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0512  hypothetical protein  48.05 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.448223  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6341  hypothetical protein  50.47 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1882  hypothetical protein  48.93 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6313  hypothetical protein  46.08 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5346  hypothetical protein  49.76 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3585  hypothetical protein  48.07 
 
 		 228 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2408  hypothetical protein  45.49 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0510  hypothetical protein  49.28 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1445  hypothetical protein  47.2 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3819  hypothetical protein  44.83 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4661  hypothetical protein  44.4 
 
 		 246 aa  184  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.560246  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3702  hypothetical protein  44.4 
 
 		 246 aa  184  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.750738  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1689  hypothetical protein  45.26 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1981  hypothetical protein  49.54 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.269571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5039  hypothetical protein  47.47 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3449  hypothetical protein  46.58 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139158  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3905  hypothetical protein  44.69 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0041  putative alcohol dehydrogenase class III  44.04 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3156  hypothetical protein  40.27 
 
 		 217 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4368  hypothetical protein  39.15 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3239  hypothetical protein  36.79 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3539  hypothetical protein  36.97 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4209  hypothetical protein  40.37 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.630826  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0072  hypothetical protein  25.46 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>