34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1689 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1689  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3585  hypothetical protein  76.32 
 
 		 228 aa  361  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1882  hypothetical protein  78.07 
 
 		 228 aa  360  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1981  hypothetical protein  75 
 
 		 228 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.269571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0510  hypothetical protein  71.63 
 
 		 230 aa  315  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0041  putative alcohol dehydrogenase class III  64.13 
 
 		 228 aa  295  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3819  hypothetical protein  55.22 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3702  hypothetical protein  54.78 
 
 		 246 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.750738  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4661  hypothetical protein  54.78 
 
 		 246 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.560246  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2408  hypothetical protein  54.15 
 
 		 229 aa  248  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5039  hypothetical protein  54.19 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6313  hypothetical protein  51.6 
 
 		 232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5346  hypothetical protein  53.69 
 
 		 226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0499  hypothetical protein  50.46 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0512  hypothetical protein  50 
 
 		 225 aa  201  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.448223  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3035  hypothetical protein  44.4 
 
 		 229 aa  201  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.225434  normal  0.011073 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1928  hypothetical protein  48.6 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1445  hypothetical protein  44.05 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6341  hypothetical protein  46.26 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0924  hypothetical protein  44.64 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.275448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3579  hypothetical protein  44.21 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4788  hypothetical protein  44.21 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5495  hypothetical protein  44.21 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543454  normal  0.390544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3905  hypothetical protein  41.77 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3812  hypothetical protein  46.33 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.626141  hitchhiker  0.0015412 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4695  hypothetical protein  45.26 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.915611 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4173  hypothetical protein  45.26 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3449  hypothetical protein  42.54 
 
 		 230 aa  181  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139158  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3156  hypothetical protein  43.4 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4368  hypothetical protein  35.87 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4209  hypothetical protein  33.17 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.630826  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3239  hypothetical protein  30.57 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3539  hypothetical protein  29.96 
 
 		 228 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0072  hypothetical protein  35.14 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>