34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3449 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3449  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  467  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139158  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3905  hypothetical protein  64.85 
 
 
237 aa  303  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561069  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1445  hypothetical protein  56.09 
 
 
225 aa  255  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218218  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2408  hypothetical protein  51.17 
 
 
229 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4661  hypothetical protein  50.7 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.560246  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3702  hypothetical protein  50.7 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.750738  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3819  hypothetical protein  50.23 
 
 
229 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717629  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5039  hypothetical protein  49.77 
 
 
226 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6313  hypothetical protein  44.44 
 
 
232 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5346  hypothetical protein  47.47 
 
 
226 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3156  hypothetical protein  49.56 
 
 
217 aa  197  9e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0499  hypothetical protein  44.6 
 
 
225 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0512  hypothetical protein  44.6 
 
 
225 aa  187  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.448223  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3035  hypothetical protein  48.37 
 
 
229 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.225434  normal  0.011073 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3812  hypothetical protein  46.58 
 
 
233 aa  184  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.626141  hitchhiker  0.0015412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3585  hypothetical protein  46.05 
 
 
228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0510  hypothetical protein  47.57 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0041  putative alcohol dehydrogenase class III  41.92 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1981  hypothetical protein  46.05 
 
 
228 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.269571  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4788  hypothetical protein  46.12 
 
 
233 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3579  hypothetical protein  46.12 
 
 
233 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1689  hypothetical protein  42.54 
 
 
228 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5495  hypothetical protein  46.12 
 
 
233 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543454  normal  0.390544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0924  hypothetical protein  45.66 
 
 
251 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.275448  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4173  hypothetical protein  46.58 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1882  hypothetical protein  44.98 
 
 
228 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4695  hypothetical protein  45.66 
 
 
233 aa  174  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.915611 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6341  hypothetical protein  43.13 
 
 
225 aa  174  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1928  hypothetical protein  41.71 
 
 
225 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4368  hypothetical protein  43.38 
 
 
225 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3539  hypothetical protein  36.16 
 
 
228 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3239  hypothetical protein  34.2 
 
 
228 aa  114  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4209  hypothetical protein  36.96 
 
 
246 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.630826  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0072  hypothetical protein  27.08 
 
 
202 aa  55.8  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>