44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1290 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1290  HupH hydrogenase expression protein  100 
 
 		 287 aa  580  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  normal  0.744496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2819  hydrogenase expression/formation protein, putative  61.64 
 
 		 291 aa  338  8e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1968  HupH hydrogenase expression protein  56.94 
 
 		 288 aa  321  8e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1156  HupH hydrogenase expression protein  43.2 
 
 		 295 aa  212  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3369  hydrogenase-1 expression HyaE  44.52 
 
 		 277 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.538768  normal  0.404781 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2153  HupH hydrogenase expression protein  43.49 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187261  normal  0.0790955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3983  HupH hydrogenase expression protein, C-terminal region  43.94 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0502  HupH hydrogenase expression/formation protein  42.56 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3104  HupH hydrogenase expression protein  44.56 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2179  HupH hydrogenase expression protein  41.81 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169361  normal  0.203382 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1637  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  36.62 
 
 		 353 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1645  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  36.62 
 
 		 353 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.714022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1704  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  36.62 
 
 		 353 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1803  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  36.62 
 
 		 353 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.080124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2023  HupH hydrogenase expression protein  40.59 
 
 		 278 aa  171  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.590217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0161  hydrogenase expression/formation protein, putative  40.58 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1638  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  35.92 
 
 		 353 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312684  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50530  hydrogenase expression/formation protein HoxQ  39.65 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0212314  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7259  HupH hydrogenase expression protein  34.54 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302833  normal  0.611247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2002  hydrogenase expression/formation  40.8 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1169  HupH hydrogenase expression protein  37.23 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3766  HupH hydrogenase expression protein  38.81 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00987  hypothetical protein  31.94 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.229942  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2619  HupH hydrogenase expression protein  31.94 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808687 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00980  HyaF  31.94 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.233288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2667  HupH hydrogenase expression protein  31.94 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.383756  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1085  hydrogenase-1 operon protein HyaF  31.94 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1092  hydrogenase-1 operon protein HyaF  31.94 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0494074  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2140  hydrogenase-1 operon protein HyaF  31.6 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.634628  normal  0.881946 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2338  hydrogenase-1 operon protein HyaF  31.6 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1213  hydrogenase-1 operon protein HyaF  31.6 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1161  HupH hydrogenase expression protein  36.24 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0867105  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0333  HupH hydrogenase expression protein  35.19 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.019475  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1989  hydrogenase-1 operon protein HyaF  32.27 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1933  hydrogenase-1 operon protein HyaF  32.27 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1343  hydrogenase-1 operon protein HyaF  32.27 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1527  hydrogenase-1 operon protein HyaF  32.27 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.912059  normal  0.309367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1929  hydrogenase-1 operon protein HyaF  32.27 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1166  hydrogenase expression/formation protein hupH  33.2 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1270  hypothetical protein  29.46 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1379  hypothetical protein  27.55 
 
 		 136 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0546269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2880  HupH hydrogenase expression protein  34.09 
 
 		 138 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.987581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3282  hydrogenase expression protein, putative  34.09 
 
 		 136 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0170  hypothetical protein  31.52 
 
 		 133 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>