44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1213 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1213  hydrogenase-1 operon protein HyaF  100 
 
 		 285 aa  579  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2667  HupH hydrogenase expression protein  99.3 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.383756  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00987  hypothetical protein  99.3 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.229942  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2619  HupH hydrogenase expression protein  99.3 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808687 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1085  hydrogenase-1 operon protein HyaF  99.3 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00980  HyaF  99.3 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.233288  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2338  hydrogenase-1 operon protein HyaF  98.95 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2140  hydrogenase-1 operon protein HyaF  98.25 
 
 		 285 aa  570  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.634628  normal  0.881946 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1092  hydrogenase-1 operon protein HyaF  98.95 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0494074  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1989  hydrogenase-1 operon protein HyaF  74.91 
 
 		 282 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1343  hydrogenase-1 operon protein HyaF  74.91 
 
 		 282 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1929  hydrogenase-1 operon protein HyaF  74.19 
 
 		 282 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1527  hydrogenase-1 operon protein HyaF  74.55 
 
 		 282 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.912059  normal  0.309367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1933  hydrogenase-1 operon protein HyaF  74.55 
 
 		 282 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1645  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  31.58 
 
 		 353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.714022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1803  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  31.52 
 
 		 353 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.080124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1704  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  31.52 
 
 		 353 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1637  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  31.16 
 
 		 353 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1638  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  31.43 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312684  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1290  HupH hydrogenase expression protein  31.6 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  normal  0.744496 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1156  HupH hydrogenase expression protein  33.57 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1169  HupH hydrogenase expression protein  35.95 
 
 		 288 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2002  hydrogenase expression/formation  35.96 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2819  hydrogenase expression/formation protein, putative  32.86 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1161  HupH hydrogenase expression protein  32.53 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0867105  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2153  HupH hydrogenase expression protein  32.19 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187261  normal  0.0790955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1968  HupH hydrogenase expression protein  31.12 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7259  HupH hydrogenase expression protein  30.74 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302833  normal  0.611247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0502  HupH hydrogenase expression/formation protein  32.88 
 
 		 272 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3104  HupH hydrogenase expression protein  31.07 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0161  hydrogenase expression/formation protein, putative  35.78 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2179  HupH hydrogenase expression protein  30.71 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169361  normal  0.203382 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3369  hydrogenase-1 expression HyaE  31.18 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.538768  normal  0.404781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3983  HupH hydrogenase expression protein, C-terminal region  35.35 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50530  hydrogenase expression/formation protein HoxQ  30.66 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0212314  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3766  HupH hydrogenase expression protein  30.91 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2023  HupH hydrogenase expression protein  30.28 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.590217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1166  hydrogenase expression/formation protein hupH  32.21 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712974  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0333  HupH hydrogenase expression protein  32.02 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.019475  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0045  HupH hydrogenase expression protein  33.05 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2880  HupH hydrogenase expression protein  35.87 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.987581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3282  hydrogenase expression protein, putative  35.87 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1270  hypothetical protein  29.6 
 
 		 150 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0253  hypothetical protein  28.17 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>