44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3983 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3983  HupH hydrogenase expression protein, C-terminal region  100 
 
 		 287 aa  588  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2819  hydrogenase expression/formation protein, putative  46.71 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1290  HupH hydrogenase expression protein  43.94 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  normal  0.744496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1968  HupH hydrogenase expression protein  42.86 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1156  HupH hydrogenase expression protein  41.7 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2153  HupH hydrogenase expression protein  42.91 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187261  normal  0.0790955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0502  HupH hydrogenase expression/formation protein  41.84 
 
 		 272 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2023  HupH hydrogenase expression protein  43.22 
 
 		 278 aa  182  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.590217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3369  hydrogenase-1 expression HyaE  42.46 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.538768  normal  0.404781 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3104  HupH hydrogenase expression protein  40.78 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1161  HupH hydrogenase expression protein  41.88 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0867105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2002  hydrogenase expression/formation  40.26 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2179  HupH hydrogenase expression protein  38.91 
 
 		 284 aa  161  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169361  normal  0.203382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1169  HupH hydrogenase expression protein  41.09 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50530  hydrogenase expression/formation protein HoxQ  36.68 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0212314  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0161  hydrogenase expression/formation protein, putative  41.31 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1637  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  34.49 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1645  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  34.49 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.714022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3766  HupH hydrogenase expression protein  38.28 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1638  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  34.49 
 
 		 353 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312684  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0333  HupH hydrogenase expression protein  39.3 
 
 		 276 aa  148  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.019475  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1803  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  34.15 
 
 		 353 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.080124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1704  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  34.15 
 
 		 353 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7259  HupH hydrogenase expression protein  34.01 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302833  normal  0.611247 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1929  hydrogenase-1 operon protein HyaF  34.07 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1343  hydrogenase-1 operon protein HyaF  34.07 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1989  hydrogenase-1 operon protein HyaF  34.07 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1527  hydrogenase-1 operon protein HyaF  34.07 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.912059  normal  0.309367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1933  hydrogenase-1 operon protein HyaF  34.07 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2140  hydrogenase-1 operon protein HyaF  32.5 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.634628  normal  0.881946 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2619  HupH hydrogenase expression protein  32.03 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808687 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00987  hypothetical protein  32.03 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.229942  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2338  hydrogenase-1 operon protein HyaF  32.03 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00980  HyaF  32.03 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.233288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1085  hydrogenase-1 operon protein HyaF  32.03 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2667  HupH hydrogenase expression protein  32.03 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.383756  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1092  hydrogenase-1 operon protein HyaF  32.03 
 
 		 285 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0494074  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1213  hydrogenase-1 operon protein HyaF  35.35 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1166  hydrogenase expression/formation protein hupH  33.48 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1270  hypothetical protein  34.51 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2880  HupH hydrogenase expression protein  35.16 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.987581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3282  hydrogenase expression protein, putative  35.16 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0170  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1379  hypothetical protein  29.79 
 
 		 136 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0546269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>