35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1379 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1379  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  267  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0546269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3282  hydrogenase expression protein, putative  43.64 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2880  HupH hydrogenase expression protein  43.64 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.987581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1270  hypothetical protein  45.53 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0170  hypothetical protein  43.64 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00345  HupH hydrogenase expression protein  33.85 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1968  HupH hydrogenase expression protein  37.9 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2023  HupH hydrogenase expression protein  37.39 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.590217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1638  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  30.89 
 
 		 353 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1704  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  30.89 
 
 		 353 aa  57  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1803  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  30.89 
 
 		 353 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.080124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1645  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  30.89 
 
 		 353 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.714022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1637  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  30.33 
 
 		 353 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0045  HupH hydrogenase expression protein  25.64 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2819  hydrogenase expression/formation protein, putative  36.59 
 
 		 291 aa  53.9  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0161  hydrogenase expression/formation protein, putative  31.03 
 
 		 278 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50530  hydrogenase expression/formation protein HoxQ  34.55 
 
 		 283 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0212314  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2179  HupH hydrogenase expression protein  38.6 
 
 		 284 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169361  normal  0.203382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1156  HupH hydrogenase expression protein  31.37 
 
 		 295 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2002  hydrogenase expression/formation  30.43 
 
 		 287 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1290  HupH hydrogenase expression protein  27.55 
 
 		 287 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00649366  normal  0.744496 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3369  hydrogenase-1 expression HyaE  31.06 
 
 		 277 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.538768  normal  0.404781 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7259  HupH hydrogenase expression protein  32.39 
 
 		 292 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302833  normal  0.611247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3983  HupH hydrogenase expression protein, C-terminal region  28.16 
 
 		 287 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1929  hydrogenase-1 operon protein HyaF  27.52 
 
 		 282 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1527  hydrogenase-1 operon protein HyaF  27.52 
 
 		 282 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.912059  normal  0.309367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0502  HupH hydrogenase expression/formation protein  31.86 
 
 		 272 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0333  HupH hydrogenase expression protein  31.07 
 
 		 276 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.019475  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2153  HupH hydrogenase expression protein  30.97 
 
 		 272 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187261  normal  0.0790955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1169  HupH hydrogenase expression protein  25.74 
 
 		 288 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1989  hydrogenase-1 operon protein HyaF  27.52 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1933  hydrogenase-1 operon protein HyaF  27.52 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1343  hydrogenase-1 operon protein HyaF  27.52 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1161  HupH hydrogenase expression protein  29.81 
 
 		 288 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0867105  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3104  HupH hydrogenase expression protein  28.16 
 
 		 277 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>