26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0253 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0253  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  630  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2002  hydrogenase expression/formation  24.88 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1169  HupH hydrogenase expression protein  28.02 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3766  HupH hydrogenase expression protein  28.02 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1161  HupH hydrogenase expression protein  24.39 
 
 		 288 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0867105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50530  hydrogenase expression/formation protein HoxQ  24.77 
 
 		 283 aa  49.7  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0212314  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1638  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  25.12 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1704  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  24.63 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1645  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  24.63 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.714022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2140  hydrogenase-1 operon protein HyaF  28.64 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.634628  normal  0.881946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1803  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  24.63 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.080124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1929  hydrogenase-1 operon protein HyaF  26.2 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1989  hydrogenase-1 operon protein HyaF  26.7 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1933  hydrogenase-1 operon protein HyaF  26.7 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1343  hydrogenase-1 operon protein HyaF  26.7 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1166  hydrogenase expression/formation protein hupH  24.4 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712974  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1527  hydrogenase-1 operon protein HyaF  26.2 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.912059  normal  0.309367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2338  hydrogenase-1 operon protein HyaF  28.17 
 
 		 285 aa  46.6  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1213  hydrogenase-1 operon protein HyaF  28.17 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00980  HyaF  28.17 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.233288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00987  hypothetical protein  28.17 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.229942  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2619  HupH hydrogenase expression protein  28.17 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808687 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1085  hydrogenase-1 operon protein HyaF  28.17 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2667  HupH hydrogenase expression protein  28.17 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.383756  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1637  hydrogenase-1 operon protein HyaF2  24.14 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1092  hydrogenase-1 operon protein HyaF  28.17 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0494074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>