38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1256 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1256  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.128186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3523  hypothetical protein  96.67 
 
 		 90 aa  176  8e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1880  hypothetical protein  95.56 
 
 		 90 aa  173  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0688  hypothetical protein  88.3 
 
 		 94 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1290  hypothetical protein  92.94 
 
 		 87 aa  163  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0456  hypothetical protein  96.3 
 
 		 91 aa  160  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.743505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2931  hypothetical protein  93.83 
 
 		 91 aa  159  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2604  hypothetical protein  86.17 
 
 		 94 aa  154  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2331  hypothetical protein  86.9 
 
 		 87 aa  154  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2656  hypothetical protein  89.02 
 
 		 95 aa  152  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.863688  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1265  hypothetical protein  92.11 
 
 		 83 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3022  hypothetical protein  93.24 
 
 		 87 aa  143  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2719  hypothetical protein  93.24 
 
 		 87 aa  143  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.30261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2622  hypothetical protein  93.33 
 
 		 87 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0019898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35960  hypothetical protein  87.65 
 
 		 84 aa  141  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4168  hypothetical protein  80 
 
 		 80 aa  128  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3434  hypothetical protein  53.52 
 
 		 70 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2088  hypothetical protein  56.16 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3187  hypothetical protein  56.72 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0666595  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2800  hypothetical protein  51.22 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.538676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3729  hypothetical protein  97.3 
 
 		 37 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7433  hypothetical protein  54.43 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.634983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2869  hypothetical protein  51.32 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1032  hypothetical protein  52.78 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3819  hypothetical protein  55.22 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3078  hypothetical protein  52.63 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0708  hypothetical protein  50.67 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3533  hypothetical protein  51.28 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1202  hypothetical protein  51.28 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2335  hypothetical protein  49.35 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0583  hypothetical protein  52.7 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3013  hypothetical protein  50.65 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7733  hypothetical protein  51.76 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4013  hypothetical protein  46.75 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0759356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0758  hypothetical protein  49.23 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.571597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0521  hypothetical protein  48.61 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2501  hypothetical protein  35.06 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6458  hypothetical protein  41.03 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.785876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>