38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2931 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2931  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  187  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0456  hypothetical protein  91.11 
 
 		 91 aa  168  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.743505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3022  hypothetical protein  92.86 
 
 		 87 aa  163  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2719  hypothetical protein  92.86 
 
 		 87 aa  163  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.30261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2622  hypothetical protein  94.05 
 
 		 87 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0019898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0688  hypothetical protein  90.59 
 
 		 94 aa  160  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1256  hypothetical protein  93.83 
 
 		 90 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.128186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3523  hypothetical protein  91.36 
 
 		 90 aa  154  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2604  hypothetical protein  89.41 
 
 		 94 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1880  hypothetical protein  90.12 
 
 		 90 aa  150  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616316  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2656  hypothetical protein  78.49 
 
 		 95 aa  148  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.863688  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2331  hypothetical protein  83.75 
 
 		 87 aa  144  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1290  hypothetical protein  81.4 
 
 		 87 aa  144  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1265  hypothetical protein  86.25 
 
 		 83 aa  143  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35960  hypothetical protein  84.62 
 
 		 84 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4168  hypothetical protein  80.26 
 
 		 80 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3434  hypothetical protein  52.05 
 
 		 70 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2088  hypothetical protein  51.76 
 
 		 87 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2800  hypothetical protein  51.76 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.538676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3187  hypothetical protein  51.85 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0666595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7433  hypothetical protein  53.16 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.634983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3729  hypothetical protein  94.44 
 
 		 37 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1032  hypothetical protein  51.39 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2869  hypothetical protein  50.67 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7733  hypothetical protein  50.6 
 
 		 84 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0708  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3819  hypothetical protein  46.99 
 
 		 84 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3078  hypothetical protein  51.85 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3533  hypothetical protein  51.95 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1202  hypothetical protein  51.95 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0583  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2335  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3013  hypothetical protein  70.73 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0758  hypothetical protein  49.23 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.571597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4013  hypothetical protein  46.67 
 
 		 84 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0759356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0521  hypothetical protein  48.48 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2501  hypothetical protein  33.77 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6458  hypothetical protein  41.03 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.785876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>