38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3022 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_3022  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  177  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2719  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  177  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.30261  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2622  hypothetical protein  95.4 
 
 
87 aa  170  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0019898  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2931  hypothetical protein  92.86 
 
 
91 aa  163  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263306  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0456  hypothetical protein  89.41 
 
 
91 aa  156  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.743505  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2604  hypothetical protein  88.1 
 
 
94 aa  153  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336669  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0688  hypothetical protein  90.12 
 
 
94 aa  151  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1256  hypothetical protein  93.24 
 
 
90 aa  143  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.128186 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1265  hypothetical protein  85.37 
 
 
83 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1880  hypothetical protein  92 
 
 
90 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616316  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35960  hypothetical protein  84.15 
 
 
84 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2656  hypothetical protein  77.53 
 
 
95 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.863688  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3523  hypothetical protein  91.89 
 
 
90 aa  140  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1290  hypothetical protein  85.71 
 
 
87 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2331  hypothetical protein  75.86 
 
 
87 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895907  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4168  hypothetical protein  82.05 
 
 
80 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3434  hypothetical protein  54.79 
 
 
70 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.598979  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2088  hypothetical protein  50.59 
 
 
87 aa  77  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2800  hypothetical protein  51.81 
 
 
84 aa  74.7  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.538676  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3187  hypothetical protein  55.22 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0666595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7433  hypothetical protein  56.16 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.634983 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1032  hypothetical protein  52.78 
 
 
80 aa  72  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108306  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2869  hypothetical protein  51.95 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0708  hypothetical protein  49.38 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3819  hypothetical protein  53.73 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481928  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7733  hypothetical protein  50.6 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3078  hypothetical protein  53.33 
 
 
83 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0583  hypothetical protein  50.65 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164107  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3533  hypothetical protein  52 
 
 
83 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234241  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1202  hypothetical protein  52 
 
 
83 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2335  hypothetical protein  51.35 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3013  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0758  hypothetical protein  49.23 
 
 
84 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.571597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4013  hypothetical protein  46.67 
 
 
84 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0759356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3729  hypothetical protein  96.67 
 
 
37 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0521  hypothetical protein  45.71 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2501  hypothetical protein  34.21 
 
 
75 aa  43.5  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6458  hypothetical protein  41.03 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.785876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>