36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2088 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2088  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  171  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2656  hypothetical protein  57.32 
 
 		 95 aa  87.4  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.863688  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0456  hypothetical protein  54.22 
 
 		 91 aa  84  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.743505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35960  hypothetical protein  58.9 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1265  hypothetical protein  55.13 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2331  hypothetical protein  56.41 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0688  hypothetical protein  57.53 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3523  hypothetical protein  57.53 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2931  hypothetical protein  51.76 
 
 		 91 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2604  hypothetical protein  56.16 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1880  hypothetical protein  56.16 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616316  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1290  hypothetical protein  56.16 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1256  hypothetical protein  56.16 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.128186 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4168  hypothetical protein  58.9 
 
 		 80 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2622  hypothetical protein  51.76 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0019898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3013  hypothetical protein  53.95 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3022  hypothetical protein  50.59 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2719  hypothetical protein  50.59 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.30261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3819  hypothetical protein  56 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1202  hypothetical protein  54.05 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7733  hypothetical protein  51.22 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3533  hypothetical protein  54.05 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3187  hypothetical protein  53.52 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0666595  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0758  hypothetical protein  56.32 
 
 		 84 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.571597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2335  hypothetical protein  55 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7433  hypothetical protein  58.33 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.634983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2869  hypothetical protein  57.38 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0708  hypothetical protein  52.38 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1032  hypothetical protein  59.68 
 
 		 80 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2800  hypothetical protein  56.72 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.538676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3078  hypothetical protein  51.32 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0521  hypothetical protein  62.07 
 
 		 79 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4013  hypothetical protein  51.35 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0759356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0583  hypothetical protein  55.56 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3434  hypothetical protein  48.65 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6458  hypothetical protein  37.68 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.785876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>