37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0521 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0521  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  155  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3819  hypothetical protein  66.67 
 
 
84 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481928  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3533  hypothetical protein  73.97 
 
 
83 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234241  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1202  hypothetical protein  73.97 
 
 
83 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2869  hypothetical protein  68.42 
 
 
83 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3078  hypothetical protein  69.62 
 
 
83 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0758  hypothetical protein  64.1 
 
 
84 aa  96.7  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.571597 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3187  hypothetical protein  66.22 
 
 
84 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0666595  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0583  hypothetical protein  68.06 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164107  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2800  hypothetical protein  66.67 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.538676  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7733  hypothetical protein  64.1 
 
 
84 aa  94.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4013  hypothetical protein  62.82 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0759356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0708  hypothetical protein  65.28 
 
 
82 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2335  hypothetical protein  61.84 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3013  hypothetical protein  62.82 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7433  hypothetical protein  64.71 
 
 
84 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.634983 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1032  hypothetical protein  61.33 
 
 
80 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108306  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2088  hypothetical protein  62.07 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35960  hypothetical protein  50.72 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2604  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336669  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2656  hypothetical protein  51.43 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.863688  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0688  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4168  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1290  hypothetical protein  51.39 
 
 
87 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3523  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1265  hypothetical protein  48.48 
 
 
83 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2931  hypothetical protein  48.48 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263306  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1880  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616316  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1256  hypothetical protein  48.61 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.128186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0456  hypothetical protein  47.22 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.743505  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3022  hypothetical protein  45.71 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2719  hypothetical protein  45.71 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.30261  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2622  hypothetical protein  45.71 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0019898  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2331  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895907  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3434  hypothetical protein  46.38 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.598979  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6458  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.785876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3862  hypothetical protein  35.53 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>