39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2335 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2335  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  169  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0708  hypothetical protein  68.29 
 
 
82 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0583  hypothetical protein  65.85 
 
 
84 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164107  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2869  hypothetical protein  63.1 
 
 
83 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7733  hypothetical protein  65.85 
 
 
84 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2800  hypothetical protein  68.29 
 
 
84 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.538676  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3533  hypothetical protein  65.06 
 
 
83 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234241  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1202  hypothetical protein  65.06 
 
 
83 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3187  hypothetical protein  60.98 
 
 
84 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0666595  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4013  hypothetical protein  59.76 
 
 
84 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0759356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3078  hypothetical protein  62.2 
 
 
83 aa  100  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7433  hypothetical protein  60.98 
 
 
84 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.634983 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3819  hypothetical protein  62.2 
 
 
84 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481928  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0758  hypothetical protein  60.24 
 
 
84 aa  98.2  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.571597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3013  hypothetical protein  61.9 
 
 
84 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0521  hypothetical protein  61.84 
 
 
79 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1032  hypothetical protein  58.33 
 
 
80 aa  89.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108306  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1880  hypothetical protein  49.4 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616316  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3523  hypothetical protein  49.4 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1290  hypothetical protein  51.28 
 
 
87 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2088  hypothetical protein  55 
 
 
87 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2656  hypothetical protein  47.56 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.863688  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35960  hypothetical protein  58.06 
 
 
84 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0688  hypothetical protein  52.7 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1256  hypothetical protein  49.35 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.128186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2604  hypothetical protein  51.35 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336669  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2331  hypothetical protein  45.78 
 
 
87 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895907  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1265  hypothetical protein  47.44 
 
 
83 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0456  hypothetical protein  48.68 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.743505  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2931  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263306  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2719  hypothetical protein  51.35 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.30261  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3022  hypothetical protein  51.35 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2622  hypothetical protein  48.72 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0019898  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4168  hypothetical protein  44.74 
 
 
80 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6458  hypothetical protein  48.78 
 
 
100 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.785876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3434  hypothetical protein  37.18 
 
 
70 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.598979  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3729  hypothetical protein  65.52 
 
 
37 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0385  hypothetical protein  40.48 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.206052  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2501  hypothetical protein  37.93 
 
 
75 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>