38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7433 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7433  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  169  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.634983 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3187  hypothetical protein  66.27 
 
 
84 aa  103  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0666595  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2800  hypothetical protein  62.2 
 
 
84 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.538676  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2335  hypothetical protein  60.98 
 
 
84 aa  99.4  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0583  hypothetical protein  63.41 
 
 
84 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164107  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3078  hypothetical protein  63.95 
 
 
83 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1032  hypothetical protein  58.54 
 
 
80 aa  96.7  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108306  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3819  hypothetical protein  57.32 
 
 
84 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481928  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3533  hypothetical protein  60.71 
 
 
83 aa  94.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234241  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1202  hypothetical protein  60.71 
 
 
83 aa  94.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0708  hypothetical protein  60 
 
 
82 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3013  hypothetical protein  60.76 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2869  hypothetical protein  54.88 
 
 
83 aa  88.6  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0758  hypothetical protein  56.47 
 
 
84 aa  88.6  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.571597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7733  hypothetical protein  55.42 
 
 
84 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4013  hypothetical protein  53.57 
 
 
84 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0759356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0521  hypothetical protein  64.71 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1880  hypothetical protein  55.7 
 
 
90 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616316  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3523  hypothetical protein  55.7 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0688  hypothetical protein  54.43 
 
 
94 aa  76.6  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2331  hypothetical protein  55.13 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895907  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35960  hypothetical protein  63.93 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1256  hypothetical protein  54.43 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.128186 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2656  hypothetical protein  52.56 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.863688  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1265  hypothetical protein  55.41 
 
 
83 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2604  hypothetical protein  54.67 
 
 
94 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336669  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0456  hypothetical protein  53.16 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.743505  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2931  hypothetical protein  53.16 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263306  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2719  hypothetical protein  56.16 
 
 
87 aa  73.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.30261  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1290  hypothetical protein  58.33 
 
 
87 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3022  hypothetical protein  56.16 
 
 
87 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2622  hypothetical protein  55 
 
 
87 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0019898  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2088  hypothetical protein  58.33 
 
 
87 aa  71.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4168  hypothetical protein  51.22 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3434  hypothetical protein  41.43 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.598979  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6458  hypothetical protein  35.9 
 
 
100 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.785876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3729  hypothetical protein  58.33 
 
 
37 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2501  hypothetical protein  38.98 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>