38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2604 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2604  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  192  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0688  hypothetical protein  91.49 
 
 		 94 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0456  hypothetical protein  92.05 
 
 		 91 aa  160  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.743505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1880  hypothetical protein  87.23 
 
 		 90 aa  156  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616316  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3523  hypothetical protein  86.17 
 
 		 90 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1256  hypothetical protein  86.17 
 
 		 90 aa  154  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.128186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1290  hypothetical protein  84.62 
 
 		 87 aa  154  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3022  hypothetical protein  88.1 
 
 		 87 aa  153  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2719  hypothetical protein  88.1 
 
 		 87 aa  153  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.30261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2931  hypothetical protein  89.41 
 
 		 91 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35960  hypothetical protein  87.95 
 
 		 84 aa  151  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2622  hypothetical protein  86.9 
 
 		 87 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0019898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2656  hypothetical protein  82.76 
 
 		 95 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.863688  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1265  hypothetical protein  89.74 
 
 		 83 aa  143  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2331  hypothetical protein  85.19 
 
 		 87 aa  141  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4168  hypothetical protein  77.5 
 
 		 80 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3434  hypothetical protein  52.63 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2088  hypothetical protein  56.16 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2800  hypothetical protein  53.01 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.538676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3187  hypothetical protein  53.75 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0666595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7433  hypothetical protein  54.67 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.634983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2869  hypothetical protein  53.25 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0583  hypothetical protein  54.05 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1032  hypothetical protein  54.29 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3819  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3533  hypothetical protein  53.33 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1202  hypothetical protein  53.33 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2335  hypothetical protein  51.35 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3013  hypothetical protein  50.68 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7733  hypothetical protein  48.75 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0708  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3078  hypothetical protein  52.05 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4013  hypothetical protein  46.67 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0759356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0758  hypothetical protein  49.28 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.571597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3729  hypothetical protein  86.49 
 
 		 37 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0521  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2501  hypothetical protein  34.21 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6458  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.785876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>