38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6458 on replicon NC_010518
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010518  Mrad2831_6458  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  202  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.785876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3862  hypothetical protein  46.32 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8426  hypothetical protein  48.61 
 
 
70 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237227  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4979  hypothetical protein  39.47 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2511  hypothetical protein  56.1 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.526212 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2501  hypothetical protein  56.1 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2335  hypothetical protein  48.78 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0583  hypothetical protein  42.11 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164107  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4013  hypothetical protein  35.06 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0759356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3013  hypothetical protein  51.22 
 
 
84 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3078  hypothetical protein  36.36 
 
 
83 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7433  hypothetical protein  35.9 
 
 
84 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.634983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1202  hypothetical protein  48.78 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3533  hypothetical protein  48.78 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234241  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0708  hypothetical protein  45.65 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3187  hypothetical protein  48.72 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0666595  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2656  hypothetical protein  46.15 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.863688  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0571  hypothetical protein  48.65 
 
 
161 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.809806  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35960  hypothetical protein  43.59 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7733  hypothetical protein  48.72 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2800  hypothetical protein  44.23 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.538676  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3819  hypothetical protein  48.72 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481928  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1290  hypothetical protein  43.59 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0688  hypothetical protein  43.59 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1032  hypothetical protein  46.67 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108306  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0521  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2869  hypothetical protein  39.29 
 
 
83 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3523  hypothetical protein  41.03 
 
 
90 aa  41.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1880  hypothetical protein  41.03 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616316  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2931  hypothetical protein  41.03 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263306  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2604  hypothetical protein  40 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336669  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2331  hypothetical protein  43.59 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895907  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3022  hypothetical protein  41.03 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2719  hypothetical protein  41.03 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.30261  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4168  hypothetical protein  32.73 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2088  hypothetical protein  37.68 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1256  hypothetical protein  41.03 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.128186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2622  hypothetical protein  41.03 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0019898  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>