38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2800 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2800  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  164  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.538676  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3819  hypothetical protein  71.95 
 
 
84 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481928  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3187  hypothetical protein  67.07 
 
 
84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0666595  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1032  hypothetical protein  69.51 
 
 
80 aa  110  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108306  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7733  hypothetical protein  67.07 
 
 
84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3533  hypothetical protein  70.73 
 
 
83 aa  107  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234241  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1202  hypothetical protein  70.73 
 
 
83 aa  107  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0758  hypothetical protein  66.67 
 
 
84 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.571597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2335  hypothetical protein  68.29 
 
 
84 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0708  hypothetical protein  68.29 
 
 
82 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3078  hypothetical protein  67.07 
 
 
83 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7433  hypothetical protein  62.2 
 
 
84 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.634983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3013  hypothetical protein  63.53 
 
 
84 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2869  hypothetical protein  67.47 
 
 
83 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4013  hypothetical protein  64.29 
 
 
84 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0759356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0583  hypothetical protein  63.1 
 
 
84 aa  97.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164107  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0521  hypothetical protein  66.67 
 
 
79 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2331  hypothetical protein  54.76 
 
 
87 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895907  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1880  hypothetical protein  52.44 
 
 
90 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616316  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35960  hypothetical protein  54.76 
 
 
84 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2931  hypothetical protein  51.76 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263306  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2656  hypothetical protein  54.22 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.863688  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3523  hypothetical protein  52.44 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0456  hypothetical protein  52.94 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.743505  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2604  hypothetical protein  53.01 
 
 
94 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336669  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1256  hypothetical protein  51.22 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.128186 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1265  hypothetical protein  50.6 
 
 
83 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1290  hypothetical protein  53.16 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2719  hypothetical protein  51.81 
 
 
87 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.30261  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3022  hypothetical protein  51.81 
 
 
87 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2622  hypothetical protein  51.19 
 
 
87 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0019898  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0688  hypothetical protein  52.38 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2088  hypothetical protein  56.72 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4168  hypothetical protein  48.1 
 
 
80 aa  67  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3434  hypothetical protein  42.86 
 
 
70 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.598979  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3729  hypothetical protein  61.76 
 
 
37 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6458  hypothetical protein  44.23 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.785876 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2501  hypothetical protein  44.44 
 
 
75 aa  40  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>