51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_R0002 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_R0002  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0020  tRNA-Cys  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.219554  normal  0.362228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0049  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 71 bp  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0034  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0017  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0016  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.348827 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07687  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0013  tRNA-Cys  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0013  tRNA-Cys  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476816  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0036  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.793802 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0035  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t26  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.286394  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0040  tRNA-Cys  90.2 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.29176  normal  0.285834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0025  tRNA-Cys  86.21 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0026  tRNA-Cys  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0045  tRNA-Cys  92.68 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0030  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.581991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0031  tRNA-Cys  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0028  tRNA-Cys  90 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259946  normal  0.0657688 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tCys01  tRNA-Cys  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00920591  normal  0.0362691 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0035  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.497187  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0027  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.258268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0036  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2286  hypothetical protein  85.45 
 
 		 462 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00240664  hitchhiker  0.00043215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0028  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0038  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0112511  hitchhiker  0.000384671 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0925  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0036  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601784  normal  0.0254396 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1032  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0035  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0037171  hitchhiker  0.000312186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0031  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0023  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125865  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0022  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0022  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0650599  normal  0.0120275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0029  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0024  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500819  normal  0.307833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0041  tRNA-OTHER  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442208 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0042  tRNA-Cys  84.29 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.220787  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1223  tRNA-Cys  84.29 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0426798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16770  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196388  normal  0.0588163 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16740  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186273  normal  0.0595565 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0031  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.931849  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  84.29 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0042  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.532077  normal  0.0630788 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15500  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00141573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11970  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000107852  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0037  tRNA-Cys  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0117844 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0020  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10760  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0456446  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0030  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000324699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0025  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>