57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11970 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_11970  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000107852  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0032  tRNA-Cys  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0027  tRNA-Cys  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000465456  normal  0.0215874 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07200  tRNA-Cys  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.867766 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1757  tRNA-Cys  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0052  tRNA-Cys  90.91 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1980  tRNA-Cys  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2329  tRNA-Cys  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00581187  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0042  tRNA-Cys  90.91 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.815028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1543  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2243  tRNA-Cys  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0004  tRNA-Cys  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.69 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.785195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0040  tRNA-Cys  87.69 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.578047  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0093  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0040  tRNA-Cys  87.69 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0128228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0650273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5684  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0257731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0459686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0087  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500213  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0538  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.435960000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4764  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000664876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5719  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00287559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0613  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000112744  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0031  tRNA-Cys  90.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0104  tRNA-Cys  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0026  tRNA-Cys  88.68 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0070  tRNA-Cys  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00415694  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1591  tRNA-Cys  88.46 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0177863  normal  0.766163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0091  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0059  tRNA-Cys  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0035  tRNA-Cys  90.7 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0037171  hitchhiker  0.000312186 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0028  tRNA-Cys  85.07 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0011  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1787  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.232461  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0018  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0032  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0037  tRNA-Cys  88 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.21352e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0049  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00399086  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0038  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000114556  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0051  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0048  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.151356  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0069  tRNA-Cys  86.54 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0001  tRNA-Cys  86.54 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0872733  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0027  tRNA-Cys  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0045  tRNA-Cys  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.364336  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0535  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt026  tRNA-Cys  84.85 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00197554  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1652  tRNA-Cys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0002  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  84.85 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1223  tRNA-Cys  84.85 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0426798  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0042  tRNA-Cys  84.85 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.220787  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0024  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.882342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>