61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_R0024 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_R0024  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500819  normal  0.307833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0030  tRNA-Cys  97.18 
 
 		 71 bp  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000324699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0023  tRNA-Cys  97.18 
 
 		 74 bp  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125865  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0031  tRNA-Cys  97.18 
 
 		 74 bp  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0028  tRNA-Cys  97.18 
 
 		 71 bp  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259946  normal  0.0657688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0029  tRNA-Cys  97.18 
 
 		 71 bp  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0035  tRNA-Cys  97.18 
 
 		 71 bp  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0045  tRNA-Cys  97.18 
 
 		 71 bp  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0629972  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0042  tRNA-Cys  97.18 
 
 		 74 bp  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178543  normal  0.586426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0039  tRNA-Cys  97.18 
 
 		 71 bp  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000510746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0042  tRNA-Cys  97.18 
 
 		 71 bp  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000509201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0039  tRNA-Cys  97.18 
 
 		 71 bp  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00256025  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0042  tRNA-Cys  97.18 
 
 		 74 bp  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.532077  normal  0.0630788 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15500  tRNA-Cys  97.18 
 
 		 74 bp  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00141573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0031  tRNA-Cys  97.18 
 
 		 71 bp  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16770  tRNA-Cys  95.77 
 
 		 71 bp  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196388  normal  0.0588163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0025  tRNA-Cys  94.37 
 
 		 71 bp  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.083387  hitchhiker  0.000430374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0026  tRNA-Cys  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.619128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0031  tRNA-Cys  92.96 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.931849  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0025  tRNA-Cys  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398428 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16740  tRNA-Cys  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186273  normal  0.0595565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0036  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 71 bp  95.6  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.381254  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0035  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 71 bp  95.6  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0034  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 71 bp  95.6  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000888056 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10760  tRNA-Cys  94.83 
 
 		 71 bp  91.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0456446  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13880  tRNA-Cys  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0819816  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0040  tRNA-Cys  94.64 
 
 		 71 bp  87.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00117723  hitchhiker  0.00882366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0019  tRNA-Cys  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0015  tRNA-Cys  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14033  tRNA-Cys  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000415175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0045  tRNA-Cys  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.34247  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0016  tRNA-Cys  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0855316  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0015  tRNA-Cys  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0038  tRNA-Cys  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0037  tRNA-Cys  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0501912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0025  tRNA-Cys  91.38 
 
 		 71 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0022  tRNA-Cys  91.38 
 
 		 71 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0022  tRNA-Cys  91.38 
 
 		 71 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0650599  normal  0.0120275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0035  tRNA-Cys  92.45 
 
 		 71 bp  73.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0037171  hitchhiker  0.000312186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0028  tRNA-Cys  97.37 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398617  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0041  tRNA-OTHER  89.66 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442208 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0022  tRNA-Cys  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0026  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0045  tRNA-Cys  86.15 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14870  tRNA-Cys  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0037  tRNA-Cys  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0025  tRNA-Cys  93.75 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0046  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0953188  normal  0.971333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0055  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0022  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.230202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0048  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0059965  normal  0.349002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0038  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0035978  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0038  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0036  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.423302  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0038  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.292986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0037  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348473  normal  0.348376 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1384  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0550643 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0013  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0007  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000892535  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0002  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0022  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>