73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_R0030 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_R0030  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.581991  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0035  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.497187  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t26  tRNA-Cys  98.61 
 
 		 74 bp  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.286394  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0035  tRNA-Cys  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0032  tRNA-Cys  95.83 
 
 		 74 bp  119  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.352047  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0036  tRNA-Cys  95.77 
 
 		 71 bp  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.793802 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0034  tRNA-Cys  94.44 
 
 		 74 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0020  tRNA-Cys  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.219554  normal  0.362228 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0017  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0049  tRNA-Cys  93.1 
 
 		 71 bp  83.8  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07687  tRNA-Cys  91.38 
 
 		 71 bp  75.8  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0026  tRNA-Cys  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0022  tRNA-Cys  91.38 
 
 		 71 bp  75.8  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0034  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528755  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0028  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tCys01  tRNA-Cys  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00920591  normal  0.0362691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0014  tRNA-Cys  87.67 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000913003  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0056  tRNA-Cys  87.67 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000403241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0037  tRNA-Cys  87.67 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0079  tRNA-Cys  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342909  hitchhiker  0.0044915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0080  tRNA-Cys  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249942  hitchhiker  0.00446925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0016  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.348827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0037  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0117844 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0087  tRNA-Cys  89.58 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500213  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt53  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000393172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0020  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0459686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0015  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000242975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0013  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201212  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0065  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000051222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0093  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0104  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0027  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0026  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000664876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0026  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000374248  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0027  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0650273  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0070  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00415694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0051  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0128228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5684  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0257731  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1223  tRNA-Cys  88.68 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0426798  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.785195  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  88.68 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4764  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0042  tRNA-Cys  88.68 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.220787  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0040  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0069  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0040  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.578047  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0091  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0059  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068081  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2454  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1864  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2769  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2153  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0538  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.435960000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0613  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000112744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5719  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00287559  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0037  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0042  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0003  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0030  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512325  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0024  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0011  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0020  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.979137  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0004  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10265 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0040  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0037  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.21352e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0002  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0008  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0032  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0029  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000761826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>