60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_R0020 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_R0020  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0045  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.364336  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0051  tRNA-Cys  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0093  tRNA-Cys  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0104  tRNA-Cys  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0026  tRNA-Cys  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0031  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.392405  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt53  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000393172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0036  tRNA-Cys  90.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.601784  normal  0.0254396 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0040  tRNA-Cys  90.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.29176  normal  0.285834 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0027  tRNA-Cys  90.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.258268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t26  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.286394  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0045  tRNA-Cys  90.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14870  tRNA-Cys  90.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0037  tRNA-Cys  96.97 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0117844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0020  tRNA-Cys  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0031  tRNA-Cys  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0034  tRNA-Cys  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528755  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0033  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0032  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.352047  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0035  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.497187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0036  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0030  tRNA-Cys  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.581991  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0037  tRNA-Cys  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0501912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0054  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.762647 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0018  tRNA-Cys  84.72 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0029  tRNA-Cys  84.72 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000761826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0027    86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583398  normal  0.0425769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0032  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392433  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0017  tRNA-Cys  88.46 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4584  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt05  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.238613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0015  tRNA-Cys  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0077  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0077  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.183947 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0582  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0087  tRNA-Cys  86.11 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500213  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0072  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0032  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0454547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0068  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.080231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0034  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0075  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0063  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0044  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0027  tRNA-Cys  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.925736  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0037  tRNA-Cys  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0027  tRNA-Cys  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0002  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0041  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.283149  normal  0.794533 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0036  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0049  tRNA-Cys  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00399086  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0034  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2286  hypothetical protein  85.19 
 
 		 462 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00240664  hitchhiker  0.00043215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0020  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.219554  normal  0.362228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0038  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0112511  hitchhiker  0.000384671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0028  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0016  tRNA-Cys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139596  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0035  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0036  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.793802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>