19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_R0037 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_R0037  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0117844 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t26  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.286394  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt53  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000393172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0020  tRNA-Cys  96.97 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0032  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.352047  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0035  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0036  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.793802 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0035  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.497187  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0030  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.581991  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0014  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.19833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0020  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.219554  normal  0.362228 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0017  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0022  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0049  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0016  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.348827 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0015  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.456495 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0005  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0056  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0002  tRNA-Cys  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>