42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_R0049 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_R0049  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0020  tRNA-Cys  98.59 
 
 		 74 bp  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.219554  normal  0.362228 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0017  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0035  tRNA-Cys  98.28 
 
 		 74 bp  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0036  tRNA-Cys  98.28 
 
 		 71 bp  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.793802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0080  tRNA-Cys  92.96 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249942  hitchhiker  0.00446925 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0034  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 74 bp  99.6  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0079  tRNA-Cys  93.85 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342909  hitchhiker  0.0044915 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07687  tRNA-Cys  95 
 
 		 71 bp  95.6  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0016  tRNA-Cys  94.92 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.348827 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t26  tRNA-Cys  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.286394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0032  tRNA-Cys  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.352047  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0022  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 71 bp  87.7  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tCys01  tRNA-Cys  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00920591  normal  0.0362691 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0035  tRNA-Cys  93.1 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.497187  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0030  tRNA-Cys  93.1 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.581991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0002  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0022  tRNA-OTHER  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0026  tRNA-Cys  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0028  tRNA-Cys  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt53  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000393172 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1223  tRNA-Cys  90.74 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0426798  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0030  tRNA-Cys  93.02 
 
 		 72 bp  54  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512325  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  90.74 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0042  tRNA-Cys  90.74 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.220787  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0011  tRNA-Cys  92.86 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0034  tRNA-Cys  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528755  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0032  tRNA-Cys  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0037  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0117844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0004  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0029  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000761826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0024  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0037  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.21352e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0047  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000253552  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0029  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0008  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0040  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0020  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.979137  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0003  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0056  tRNA-Cys  89.13 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000403241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0037  tRNA-Cys  89.13 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0014  tRNA-Cys  89.13 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000913003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>