11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_R0022 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_R0022  tRNA-OTHER  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0079  tRNA-Cys  92.98 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342909  hitchhiker  0.0044915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0080  tRNA-Cys  92.98 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249942  hitchhiker  0.00446925 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07687  tRNA-Cys  89.47 
 
 
71 bp  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0049  tRNA-Cys  87.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406047  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0017  tRNA-Cys  87.27 
 
 
74 bp  54  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0020  tRNA-Cys  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.219554  normal  0.362228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tCys01  tRNA-Cys  85.45 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00920591  normal  0.0362691 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0036  tRNA-Cys  85.45 
 
 
71 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.793802 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0035  tRNA-Cys  85.45 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0016  tRNA-Cys  85.19 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.348827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>